黄巢听闻拓拔思恭大破王玫，大怒，下令：“御驾亲征”。率领十万大军直扑兴平，令左番功臣张归霸、张归厚和张归弁昆仲三人领兵三万为先锋，拓拔思恭听闻黄巢大军到来，连忙召集李铤和巩固商议对策，李铤怒说：“贼寇皆废物，来十万我照样取他十万人的人头。”拓拔思恭壮之，令李铤和巩固领兵出战，两军对垒，张归厚出马，大叫：“兴平贼寇，快出马受死。”李铤大怒，飞身而出，挺枪就刺向张归厚，张归厚用长槊抵挡，两人大战七十回合，李铤一枪刺向张归厚的门面，张归厚一躲，顺手抓住李倓的长枪，一槊就将李铤刺死。巩固大怒，舞着大刀冲出，张归弁拔剑接住厮杀，七十回合又把巩固砍于马下，张归霸领兵一阵冲杀，兴平军大败。
拓拔思恭听闻农民军先锋锐不可当，连忙挂出免战牌。黄巢来到兴平，张归霸兄弟三人接驾，黄巢下令：“全军出击，踏平兴平城。”大齐大军蜂拥攻城，拓拔思恭率军拼死抵挡，眼看就要拿下兴平城，突然东边前线来报：“同州防御使朱温投降唐军，丞相尚让、林言、李祥和黄思鄴受到李昌符、唐弘夫、王重荣、朱温等围攻，请皇上速回师救援。”黄巢大惊，连忙下令撤军。
华州刺史李详听闻朱温归顺朝廷得到封官进爵，亦欲献款投降，监军黄思鄴察觉，斩李详于赤水，黄巢以黄思鄴为刺史。
黄巢令大将李公迪率军三万挡兴平官军，自己率大军返回长安。李昌符、程宗楚和塑方节度使唐弘夫与林言、尚让战于咸阳城下，两军对垒，双方战鼓齐鸣，唐弘夫出马，大叫说：“贼寇，快快出马与我决一死战。”林言大怒，拔剑出马，两人大战，五十回合后不敌，唐弘夫一马当先，领军冲杀，尚让、林言大败，退三十里下寨，林言与尚让商议对策，尚让说：“兴平已失，咸阳也保不住了，我们还是撤回长安，再从长计议。”两人于是下令向长安撤退。此时，关中官军四集，全国各地藩镇纷纷出兵勤王，官军士气大振，不断对长安进行合围。
十月，王铎浚壕于兴平，左抵马嵬，使将薛韬主持修建，由马嵬、武功入斜谷，以通山水，列屯十四，使将梁璩主之，置关于沮水、七盘、三溪、木皮岭，以遮挡秦、陇。王铎派京左行营都统东方逵击黄巢锐将李公迪。双方出列，东方逵在阵前横刀立马，大叫：“贼寇出来受死。”李公迪大怒，飞马出战，双方大战三十回合，东方逵手到擒来把李公迪禽拿。东方逵一鼓作气连破敌堡三十，巢军死伤无数。
王重荣取华州，华州李详的部将听说重荣大军到来，逐黄思邺，黄思邺奔回长安告急，黄巢大怒，训退黄思邺，以王遇为刺史，令其领兵平叛，王遇带兵数万来到华州，王重荣领兵出击，两军对垒，王重荣怒对王遇说：“你我皆姓王，八百年前可能是一家，你识相的就快快投降，免得我们伤了兄弟和气。”还没等王遇搭话，重荣立即领军冲杀，河中兵锐不可当，一阵横击，王遇大败，逼迫投降王重荣。
黄巢丧二州，怒甚，自将精兵五万壁梁田。王重荣军华阴，杨复光军渭北，形成掎角之势。两军对垒，双方大骂。王重荣出马大叫说：“黄巢速速出马受死。”黄巢大怒拍马而出，两人大战，一百回合后，不分胜负，两边的将士都怕自己的主帅受伤，于是蜂拥而上，双方大战到下午，战场上血肉横飞。突然，杨复光领军从渭北杀来，张归霸连忙率兵抵挡，杨复光的养子杨守宗和张归霸大战，双方战到傍晚，诸葛爽带领将士赶来，一阵大射，黄巢大败，赵璋被擒，巢中流矢走，张归霸三兄弟一边战一边撤退。大齐军士死伤数万，王重荣兵亦死耗相当。王重荣惧黄巢复振，忧之，与杨复光计，杨复光说：“李克用大军将到，黄巢死期到矣！”
杨复光刚击败黄巢，家里的奴仆就送信来说：“太君病重，请主公速速返回。”杨复光大惊，把军事交王重荣，立即下令备马，杨复光急急忙忙赶回福建，刚走进家门，其母就去世了，杨复光痛哭流涕。僖宗听说杨母去世，赏银万两以办丧事，赐忠武夫人。守孝之夜，杨复光回想自己当年年幼就入宫，从来没有尽过孝心，心如刀割。其养子杨守宗在旁劝说：“忠孝不能够两全，啊父还是节哀顺便吧。”厚葬其母亲后，杨复光对众亲人说：“为人子者，应该为其父母守孝三年，但现在国家多难，巢贼还没灭，吾不能够以一己之私而负天下。”于是留下财产万千给家族的亲人就离开了福建。
中和三年正月，李克用屯兵乾坑。黄巢军看到像乌鸦一样的军队到来，惊恐的说：“鸦儿军到了”。黄巢听闻李克用到来，乃与众谋士商议对策，孟楷说：“李克用勇冠三军，沙陀兵勇不可挡，出战的时候经常披着黑袍，人称黑乌鸦，不好对付。”黄巢说：“既然这样，我们就收买李克用，大家有何良策？郑汉璋说：“听说李克用之仲弟李克让为山僧所害，现在其属下纪纲、浑进通还在我们军营，我们派兵去把山僧杀了，替其弟报仇，李克用一定感激我们，然后我们再以重利收买李克用，相信其一定为我们所用。”黄巢大喜，令郑汉璋带兵五百和纪纲、浑进通一起去诛杀南山山僧。
郑汉璋和纪纲、浑进通拿着大刀杀气腾腾的来都南山寺，士兵们拼命敲门，山僧打开寺门忙问：“何事？”纪纲一刀就把